Spațiul grădinii este împărțit în mai multe sectoare, fiecare cu specificul său:
– ornamental: unde sunt cultivate zeci de specii cu sute de soiuri de plante lemnoase și ierboase
– fitogeografic: în care sunt expuse plante caracteristice zonelor aride din Africa și America Centrală, formațiunilor ierboase și lemnoase din America de Nord, Extremul Orient, din Himalaya și Altai, din Caucaz și Balcani, precum și comunitățile vegetale din principalele regiuni istorice ale țării noastre
– sistematic: constituie o carte vie de botanică, în care speciile sunt grupate pe familii, dispuse în ordine filogenetică, dupa sistemul original al prof. Al. Borza
– economic și medicinal
În incinta Grădinii Botanice este situat și Institutul Botanic, reprezentat de colectivul de botanică al facultății de Biologie și Geologie, de Muzeul Botanic (cu 6.900 de piese divers conservate) și Herbarul Universității (care adaposteste 660.000 coli de herbar cu plante provenite din toate regiunile globului). Prin modul de amenajare, bogația specifică și funcțiile îndeplinite, acest obiectiv reprezintă, pe drept cuvânt, o perlă a municipiului nostru și un patrimoniu național ce trebuie cunoscut și protejat.